Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
RRBP1Q9P2E9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RRBP1Q9P2E9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
RRBP1Q9P2E9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RRBP1Q9P2E9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms