Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
MBD5Q9P267 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
MBD5Q9P267 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MBD5Q9P267 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms