Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL20A1Q9P218 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL20A1Q9P218 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL20A1Q9P218 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms