Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAMSAP3Q9P1Y5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAMSAP3Q9P1Y5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAMSAP3Q9P1Y5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAMSAP3Q9P1Y5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CAMSAP3Q9P1Y5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAMSAP3Q9P1Y5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAMSAP3Q9P1Y5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAMSAP3Q9P1Y5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAMSAP3Q9P1Y5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAMSAP3Q9P1Y5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAMSAP3Q9P1Y5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAMSAP3Q9P1Y5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CAMSAP3Q9P1Y5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAMSAP3Q9P1Y5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAMSAP3Q9P1Y5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAMSAP3Q9P1Y5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAMSAP3Q9P1Y5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMSAP3Q9P1Y5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMSAP3Q9P1Y5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMSAP3Q9P1Y5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMSAP3Q9P1Y5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMSAP3Q9P1Y5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMSAP3Q9P1Y5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMSAP3Q9P1Y5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMSAP3Q9P1Y5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMSAP3Q9P1Y5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMSAP3Q9P1Y5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMSAP3Q9P1Y5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMSAP3Q9P1Y5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMSAP3Q9P1Y5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms