Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MCM9Q9NXL9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MCM9Q9NXL9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM9Q9NXL9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms