Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGEF38Q9NXL2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGEF38Q9NXL2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms