Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TOR4AQ9NXH8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TOR4AQ9NXH8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms