Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DNAJC28Q9NX36 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNAJC28Q9NX36 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJC28Q9NX36 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 302.2 ms