Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IFT57Q9NWB7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
IFT57Q9NWB7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IFT57Q9NWB7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms