Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC39A9Q9NUM3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC39A9Q9NUM3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms