Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOXD4L1Q9NU39 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXD4L1Q9NU39 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms