Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP13A2Q9NQ11 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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