Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM8AQ9HCN3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM8AQ9HCN3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM8AQ9HCN3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms