Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3E2

SNX25, Sorting nexin-25, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX25Q9H3E2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX25Q9H3E2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX25Q9H3E2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms