Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C0

GAN, Gigaxonin, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GANQ9H2C0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GANQ9H2C0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms