Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMEM39BQ9GZU3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM39BQ9GZU3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM39BQ9GZU3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms