Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTPBP4Q9BZE4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP4Q9BZE4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms