Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDC1Q9BTX1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDC1Q9BTX1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms