Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYT11Q9BT88 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms