Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
UPK3BQ9BT76 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UPK3BQ9BT76 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms