Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTKNQ9BST9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTKNQ9BST9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms