Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTP3Q9BQQ7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RTP3Q9BQQ7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms