Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITX2Q99697 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PITX2Q99697 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms