Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELF4Q99607 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ELF4Q99607 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELF4Q99607 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms