Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
EYA3Q99504 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EYA3Q99504 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms