Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CDRT15Q96T59 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDRT15Q96T59 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
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