Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CDK5RAP2Q96SN8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK5RAP2Q96SN8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK5RAP2Q96SN8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms