Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NLRP3Q96P20 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRP3Q96P20 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NLRP3Q96P20 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRP3Q96P20 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms