Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC43Q96MW1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC43Q96MW1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms