Protein–RNA interactions for Protein: Q96L34

MARK4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK4Q96L34 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MARK4Q96L34 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MARK4Q96L34 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms