Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
MS4A3Q96HJ5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MS4A3Q96HJ5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A3Q96HJ5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms