Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OTUB1Q96FW1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.33■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.3■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.29■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
OTUB1Q96FW1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms