Protein–RNA interactions for Protein: Q96BZ4

PLD4, Phospholipase D4, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD4Q96BZ4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLD4Q96BZ4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLD4Q96BZ4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLD4Q96BZ4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLD4Q96BZ4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLD4Q96BZ4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLD4Q96BZ4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLD4Q96BZ4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLD4Q96BZ4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLD4Q96BZ4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PLD4Q96BZ4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLD4Q96BZ4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLD4Q96BZ4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLD4Q96BZ4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PLD4Q96BZ4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLD4Q96BZ4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLD4Q96BZ4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms