Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC127Q96BQ5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC127Q96BQ5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms