Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TOP1MTQ969P6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOP1MTQ969P6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
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