Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GATA6Q92908 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GATA6Q92908 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GATA6Q92908 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms