Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RABGGTAQ92696 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RABGGTAQ92696 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
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