Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM9SF4Q92544 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TM9SF4Q92544 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms