Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG4AQ8WYN0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms