Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GATAD2BQ8WXI9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATAD2BQ8WXI9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms