Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASKIN2Q8WXE0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASKIN2Q8WXE0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CASKIN2Q8WXE0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms