Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRF4Q8WWF5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF4Q8WWF5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms