Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG1Q8WTW3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COG1Q8WTW3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG1Q8WTW3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms