Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MDM1Q8TC05 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms