Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYRIPQ8NFW9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYRIPQ8NFW9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYRIPQ8NFW9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms