Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPRYD3Q8NCJ5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPRYD3Q8NCJ5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPRYD3Q8NCJ5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPRYD3Q8NCJ5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPRYD3Q8NCJ5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPRYD3Q8NCJ5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPRYD3Q8NCJ5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPRYD3Q8NCJ5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPRYD3Q8NCJ5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPRYD3Q8NCJ5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SPRYD3Q8NCJ5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SPRYD3Q8NCJ5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPRYD3Q8NCJ5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPRYD3Q8NCJ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SPRYD3Q8NCJ5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SPRYD3Q8NCJ5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SPRYD3Q8NCJ5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms