Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HJURPQ8NCD3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HJURPQ8NCD3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms