Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SPC24Q8NBT2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPC24Q8NBT2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPC24Q8NBT2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPC24Q8NBT2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
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