Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUMF1Q8NBK3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMF1Q8NBK3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SUMF1Q8NBK3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms