Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDCL2Q8N4E4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCL2Q8N4E4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms